Una de las formas para trabajar la investigación en el aula se basa en la identificación de problemas, intereses y necesidades de los estudiantes. Cuando se habla de Enseñanza Problémica se considera la forma de organizar los contenidos de la enseñanza desde problemas y preguntas de los saberes a través de la  historia, además de la relación con los problemas y preguntas de la vida cotidiana, con base en la perspectiva de las distintas disciplinas que pueden aportar a la solución del problema identificado.

Con la Enseñanza Problémica se busca la construcción del saber escolar, desde múltiples interrogantes que permitan percibir las contradicciones, las  tendencias y las posibles formas de solución. Con la identificación múltiples problemas se provoca la construcción social y colaborativa del conocimiento a través de los aprendizajes de los estudiantes. La consideración de la creatividad se asume como un aspecto en la metodología, que vincula los intereses particulares y no las secuencias de contenidos.

El programa se basa en los problemas y en las necesidades que se requieren de ciertos contenidos para ser abordados, de manera parcial porque las preguntas y los conocimientos se abordan de forma parcial, o como resultados parciales, de manera que se hace alusión a la metodología de proyectos y la pedagogía de la  pregunta. De lo que se trata entonces, es que docentes y estudiantes identifiquen los problemas y preguntas significativas de la realidad para hacer las indagaciones, búsquedas y experimentaciones que permitan su solución, con el abordaje de contenidos, bibliografías y diversas actividades de confrontación.

Se asume que el profesor analiza y escribe documentos sobre los temas y problemas, los confronta con otros y de similar forma, los estudiantes escriben, confrontan y debaten sus escritos. No en vano, la Pedagogía Problemática aprovecha la capacidad autónoma, creadora y el autoperfeccionamiento para aprender en el contexto de una cultura, de forma que al resolver un problema se de cuenta de las contradicciones existentes.

La Pedagogía problemática concibe procesos de Enseñanza, de Investigación y diversas  Metodologías, donde el  maestro hace la conexión con el conocimiento  a través de exposiciones que generan preguntas complementarias y nuevos intereses de la propia ciencia y en lo pedagógico se relacionan las sentencias de “aprender a aprender”, “aprender a hacer” y “aprender a ser en contexto”, que llevan a las prácticas de los estudiantes para confrontar la bibliografía, ejercitación de teorías y la solución de problemas para la confrontación de enfoques, tendencias y alternativas, lo que da prioridad a las actividades de aprendizaje colaborativo e independiente.

Unas Fases que se pueden considerar desde la Pedagogía Problémica pueden ser:

- Selección de los problemas  y elaboración de la pregunta

- Rastreos teóricos en relación con el contexto de la búsqueda

- Sistematización de las lecturas en un referente teórico

- Ejecución de los mecanismos de comprobación e indagación

- Socialización de avances, informes y desarrollos

La enseñanza problémica tiene un carácter interdisciplinar y transdisciplina, de allí que permita nuevas miradas sobre los problemas existentes y proyecte soluciones a alternativas que no se hayan considerado.